По правилам эксплуатации котельных, если котельная полностью автоматизированная, должен ли на ней постоянно присутствовать персонал?

Наличие / отсутствие персонала должно быть оговорено в проекте, мне так думается. Там же прописывается диспетчеризация.

Какое топливо?

ПБ 12-529-03 "Правила безопасности систем газораспределения и газопотребления":

5.9.13. Допускается эксплуатация газоиспользующих установок без постоянного наблюдения со стороны персонала при оборудовании их системой автоматизации, обеспечивающей безаварийную работу и противоаварийную защиту в случае возникновения неполадок.
Сигналы о загазованности и неисправности оборудования, состоянии охранной сигнализации помещения, где оно размещено, должны выводиться на диспетчерский пункт или в помещение с постоянным присутствием работающих, способных направить персонал для принятия мер или передать информацию в организацию, с которой заключен договор на обслуживание.

Природный газ